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Liao Chenyan
Grafischer Assistent für molekulare BerechnungenIn Entwicklung · Desktop und Mobil

MolloM

MolloM

Am Rechner Strukturen vorbereiten, Parameter einstellen und Berechnungen planen. Auf dem Smartphone Ergebnisse prüfen und noch nicht gestartete Pläne bearbeiten.

Aus einer Molekülbibliothek werden Kandidaten für einen genaueren Blick.

Konzeptdarstellung einer Molekülbibliothek, eines Proteinbändermodells und eines Liganden.
  1. Bibliothek vorbereiten

    Strukturen und Kennungen prüfen und die Herkunft jedes Moleküls festhalten.

  2. Docking und Screening

    Posen, Scores und Aufgabenstatus vergleichen, nicht nur den ersten Platz.

  3. Kandidaten prüfen

    Strukturen und Einstellungen erneut ansehen, bevor die nächste Untersuchung beginnt.

  4. Molekulardynamik

    Das System vorbereiten und prüfen, dann seine zeitliche Strukturentwicklung untersuchen.

Strukturen vorbereiten, Parameter einstellen, Berechnungen starten

MolloM vereint eingebundene Docking- und Molekulardynamikprogramme in einer Oberfläche: Strukturen vorbereiten, Parameter einstellen, Berechnungen starten und Ergebnisse sowie Protokolle ansehen.

  1. Werkzeuge vorbereiten

    Das Softwarezentrum erkennt vorhandene Programme und bietet Installation, Versionsverwaltung und Prüfungen für unterstützte Integrationen. Rechner oder SSH-Server auswählen, Eingaben prüfen und die Docking-Box in 3D festlegen. Installation hängt von Betriebssystem, Lizenz und verfügbaren Paketen ab.

  2. Parameter zugänglich halten

    Suchaufwand, Seeds, CPU-/GPU-Optionen sowie GROMACS-Laufzeit- und MDP-Einstellungen bleiben konfigurierbar. Spezifische Bedienelemente und native Protokolle erlauben die Prüfung vor dem Start.

  3. Große Stapel gezielt bearbeiten

    Ein kleiner Probelauf hilft, Laufzeit und Ressourcen einzuschätzen. Engines und Filter werden pro Runde gewählt; nur fehlgeschlagene Einträge werden wiederholt. Herkunft der Kandidaten, Ergebnisse und Protokolle bleiben nachvollziehbar und seitenweise lesbar. Der Durchsatz muss mit eigener Hardware und eigenen Daten geprüft werden.

Am Rechner vorbereiten. Unterwegs nachsehen.

Desktop

Proteine und Liganden vorbereiten, Strukturen in 3D prüfen, Boxen, Engines und Ressourcen einstellen und lokale oder Server-Aufträge starten. Dazu kommen Screening-Runden, Wiederherstellung, Export sowie GROMACS-Simulationen und Trajektorienanalysen. Docking und MD sind unabhängig nutzbar.

Mobil

Projekte, Fortschritt, Ergebnisübersichten und Protokolle des verbundenen Rechners lesen. Notizen, Favoriten, Kandidatenvergleiche und datierte Offline-Kopien behalten. Bei unterstützten Projekten lassen sich ausstehende Pläne ändern und Änderungen prüfen. Der Start verlangt eine eigene Berechtigung und Ressourcenbestätigung.

Echte Entwicklungsoberflächen mit Demo-Einstellungen und simulierten Aufgaben. Keine reale Berechnung wurde gestartet.

Zuerst den eigenen Computer oder Server verbinden, die Geräte koppeln und Zugriffsrechte erteilen.

Bestehende Engines, nachvollziehbare Schritte

MolloM ist keine neue Docking- oder MD-Engine. Es ruft Programme auf und behält Originalausgaben, Parameter und Versuche. Projektpakete nehmen ausgewählte Eingaben und Ergebnisse mit. KI-Agenten können über MCP Status lesen oder Pläne vorbereiten.

Rechenorte und Datenübertragung

Docking und Simulationen laufen auf dem eigenen Rechner oder gewählten Server. Kontoverbindungen können ausgewählte Auftragsstatus, Ergebnisübersichten und Protokolle ans Telefon weiterleiten. Softwareinstallation und aktivierte externe Dienste nutzen ebenfalls das Netz.

Bedienung abgeben, wissenschaftlich selbst entscheiden

Docking-Scores und Trajektorien helfen beim Kandidatenvergleich; allein belegen sie weder Bindung noch Mechanismus. Molekülidentität, Protonierung, Kraftfelder, Sampling und experimentelle Evidenz bleiben für die Interpretation wichtig.

Downloads und Plattformen

Desktop- und Mobil-Apps sind in Entwicklung. Offizielle Installer und Store-Links stehen noch nicht bereit. Nach der Veröffentlichung finden sich hier Downloads, Systemanforderungen und Installationshinweise.

Geplante Plattformen

Desktop

  • macOSNoch nicht veröffentlicht
  • WindowsNoch nicht veröffentlicht
  • LinuxNoch nicht veröffentlicht

Mobil

  • iOS / iPadOSNoch nicht veröffentlicht
  • AndroidNoch nicht veröffentlicht
  • HarmonyOS NEXTNoch nicht veröffentlicht
Entwickler kontaktieren