Vai al contenuto
Liao Chenyan
Un agente grafico per il calcolo molecolareIn sviluppo · desktop e mobile

MolloM

MolloM

Prepara strutture, imposta parametri e organizza calcoli al computer. Ritrova risultati e piani ancora da inviare sul telefono.

Da una libreria di molecole a pochi candidati da approfondire.

Illustrazione concettuale di una libreria molecolare, una proteina a nastro e un ligando.
  1. Preparare la libreria

    Verificare strutture e identificativi, conservando la provenienza di ogni molecola.

  2. Docking e screening

    Confrontare pose, punteggi e stato delle attività, non solo il primo risultato.

  3. Rivedere i candidati

    Tornare a strutture e parametri prima di decidere il passo successivo.

  4. Dinamica molecolare

    Preparare e verificare il sistema, poi studiare come cambia nel tempo.

Preparare strutture, impostare parametri, inviare calcoli

MolloM riunisce gli strumenti integrati di docking e dinamica molecolare in un’interfaccia: prepara strutture, imposta parametri, invia calcoli e consulta risultati e registri.

  1. Preparare gli strumenti

    Il centro software rileva gli strumenti presenti e offre installazione, gestione delle versioni e verifiche per le integrazioni supportate. Scegli computer o server SSH, controlla gli input e il box in 3D. Installazione, licenza e pacchetti dipendono dal sistema.

  2. Tenere i parametri a portata di mano

    Sforzo di ricerca, seed, opzioni CPU/GPU e impostazioni GROMACS e MDP restano configurabili. Controlli specifici e protocolli nativi permettono di verificare le scelte prima dell’invio.

  3. Gestire un lotto senza ricominciare

    Una piccola prova aiuta a stimare tempi e risorse. Scegli motori e filtri per ciclo, ripeti soltanto gli elementi falliti e conserva l’origine dei candidati. Risultati e registri si leggono per pagine. Le prestazioni vanno comunque verificate con i propri dati e hardware.

Prepara al computer, prosegui dal telefono

Desktop

Preparazione di proteine e ligandi, strutture 3D, box, motori, risorse e invio locale o remoto. Gestione dei cicli, recupero degli errori, esportazione, simulazioni GROMACS e analisi delle traiettorie. Docking e MD sono utilizzabili separatamente.

Mobile

Consulta progetti, avanzamento, riepiloghi e registri del computer collegato. Conserva note, preferiti, confronti e copie offline datate. Per i progetti compatibili, modifica i piani non ancora inviati e controlla le differenze. L’avvio richiede un permesso separato e la conferma delle risorse.

Interfacce reali di sviluppo con impostazioni dimostrative e attività simulate. Nessun calcolo reale è stato avviato.

Collega prima il tuo computer o server, abbina i dispositivi e concedi i permessi di accesso.

Motori esistenti, lavoro tracciabile

MolloM non è un nuovo motore di docking o MD: richiama programmi esistenti e conserva output, parametri e tentativi. I pacchetti portano input e risultati selezionati. Gli agenti IA compatibili possono leggere stati o preparare piani via MCP.

Dove si calcola e come viaggiano i dati

Docking e simulazioni si eseguono sul computer o server scelto. Le connessioni dell’account possono inoltrare al telefono stati, riepiloghi e registri selezionati. Anche l’installazione di software e i servizi esterni attivati usano la rete.

Delegare le operazioni, non il giudizio scientifico

Punteggi di docking e traiettorie aiutano a confrontare i candidati, ma da soli non dimostrano un legame o un meccanismo. L’interpretazione dipende anche da identità molecolare, protonazione, campi di forza, campionamento e dati sperimentali.

Download e piattaforme

Le app desktop e mobile sono in sviluppo. Installer ufficiali e link agli store non sono ancora disponibili. Dopo il rilascio, qui saranno pubblicati download, requisiti e istruzioni.

Piattaforme previste

Desktop

  • macOSNon ancora pubblicato
  • WindowsNon ancora pubblicato
  • LinuxNon ancora pubblicato

Mobile

  • iOS / iPadOSNon ancora pubblicato
  • AndroidNon ancora pubblicato
  • HarmonyOS NEXTNon ancora pubblicato
Contatta lo sviluppatore