К содержимому
Liao Chenyan
Графический помощник для молекулярных расчётовВ разработке · компьютер и телефон

MolloM

MolloM

Готовьте структуры, задавайте параметры и организуйте расчёты на компьютере. Просматривайте результаты и работайте с ещё не запущенными планами на телефоне.

От библиотеки молекул к кандидатам для подробного изучения.

Концептуальная иллюстрация библиотеки молекул, ленточной модели белка и лиганда.
  1. Подготовка библиотеки

    Проверить структуры и идентификаторы, сохранив происхождение каждой молекулы.

  2. Докинг и скрининг

    Сравнить позы, оценки и состояние задач, а не только первый результат.

  3. Проверка кандидатов

    Вернуться к структурам и настройкам, прежде чем выбирать следующее исследование.

  4. Молекулярная динамика

    Подготовить и проверить систему, затем изучить изменение её структуры во времени.

Подготовить структуры, задать параметры, запустить расчёты

MolloM объединяет подключённые инструменты докинга и молекулярной динамики в одном интерфейсе: подготовка структур, настройка параметров, запуск расчётов, просмотр результатов и журналов.

  1. Подготовить программы

    Центр ПО обнаруживает установленные инструменты и предлагает установку, управление версиями и проверку поддерживаемых интеграций. Выберите компьютер или SSH-сервер, проверьте входные файлы и область докинга в 3D. Установка зависит от ОС, лицензии и доступных пакетов.

  2. Сохранить доступ к параметрам

    Глубина поиска, seed, CPU/GPU, параметры запуска GROMACS и MDP остаются настраиваемыми. Специальные элементы управления и собственные протоколы программ позволяют проверить настройки перед отправкой.

  3. Не пересчитывать всю партию

    Небольшой пробный запуск помогает оценить время и ресурсы. Выбирайте движок и фильтры для каждого раунда, повторяйте только сбои, сохраняйте происхождение кандидатов. Результаты и журналы загружаются постранично. Производительность нужно проверять на своих данных и оборудовании.

Подготовка на компьютере, контроль с телефона

Компьютер

Подготовка белков и лигандов, просмотр 3D-структур, настройка области, движка и ресурсов, локальные и серверные задания. Раунды скрининга, восстановление, экспорт, симуляции GROMACS и анализ траекторий. Докинг и MD можно использовать независимо.

Мобильные устройства

Просмотр проектов, хода работы, сводок результатов и журналов подключённого компьютера. Заметки, избранное, сравнение кандидатов и офлайн-копии с временем чтения. Для поддерживаемых проектов можно менять ещё не отправленные планы и проверять различия. Запуск требует отдельного разрешения и подтверждения ресурсов.

Реальные интерфейсы разрабатываемого приложения с демонстрационными настройками и имитацией задач. Реальные расчёты не запускались.

Сначала подключите свой компьютер или сервер, выполните сопряжение устройств и предоставьте права доступа.

Знакомые движки, сохранённая история работы

MolloM не является новым движком докинга или MD. Он вызывает существующие программы и сохраняет исходные результаты, параметры и попытки. Пакеты проектов содержат выбранные входы и результаты. Совместимые ИИ-агенты могут читать статус или готовить планы через MCP.

Где идут расчёты и как передаются данные

Докинг и симуляции выполняются на вашем компьютере или выбранном сервере. Подключение через аккаунт может передавать на телефон выбранные статусы задач, сводки и журналы. Установка программ и включённые внешние сервисы также используют сеть.

Передать операции, но не научное решение

Оценки докинга и траектории помогают сравнивать кандидатов, но сами по себе не доказывают связывание или механизм. Интерпретация также зависит от идентичности молекул, протонирования, силовых полей, выборки и экспериментальных данных.

Загрузки и платформы

Приложения для компьютеров и телефонов находятся в разработке. Официальных установщиков и ссылок на магазины пока нет. После выпуска здесь появятся загрузки, системные требования и инструкции.

Планируемые платформы

Компьютер

  • macOSПубличный выпуск ещё не состоялся
  • WindowsПубличный выпуск ещё не состоялся
  • LinuxПубличный выпуск ещё не состоялся

Мобильные устройства

  • iOS / iPadOSПубличный выпуск ещё не состоялся
  • AndroidПубличный выпуск ещё не состоялся
  • HarmonyOS NEXTПубличный выпуск ещё не состоялся
Связаться с разработчиком