MolloM

Готовьте структуры, задавайте параметры и организуйте расчёты на компьютере. Просматривайте результаты и работайте с ещё не запущенными планами на телефоне.
От библиотеки молекул к кандидатам для подробного изучения.

Подготовка библиотеки
Проверить структуры и идентификаторы, сохранив происхождение каждой молекулы.
Докинг и скрининг
Сравнить позы, оценки и состояние задач, а не только первый результат.
Проверка кандидатов
Вернуться к структурам и настройкам, прежде чем выбирать следующее исследование.
Молекулярная динамика
Подготовить и проверить систему, затем изучить изменение её структуры во времени.
Подготовить структуры, задать параметры, запустить расчёты
MolloM объединяет подключённые инструменты докинга и молекулярной динамики в одном интерфейсе: подготовка структур, настройка параметров, запуск расчётов, просмотр результатов и журналов.
Подготовить программы
Центр ПО обнаруживает установленные инструменты и предлагает установку, управление версиями и проверку поддерживаемых интеграций. Выберите компьютер или SSH-сервер, проверьте входные файлы и область докинга в 3D. Установка зависит от ОС, лицензии и доступных пакетов.
Сохранить доступ к параметрам
Глубина поиска, seed, CPU/GPU, параметры запуска GROMACS и MDP остаются настраиваемыми. Специальные элементы управления и собственные протоколы программ позволяют проверить настройки перед отправкой.
Не пересчитывать всю партию
Небольшой пробный запуск помогает оценить время и ресурсы. Выбирайте движок и фильтры для каждого раунда, повторяйте только сбои, сохраняйте происхождение кандидатов. Результаты и журналы загружаются постранично. Производительность нужно проверять на своих данных и оборудовании.
Подготовка на компьютере, контроль с телефона
Компьютер
Подготовка белков и лигандов, просмотр 3D-структур, настройка области, движка и ресурсов, локальные и серверные задания. Раунды скрининга, восстановление, экспорт, симуляции GROMACS и анализ траекторий. Докинг и MD можно использовать независимо.
Мобильные устройства
Просмотр проектов, хода работы, сводок результатов и журналов подключённого компьютера. Заметки, избранное, сравнение кандидатов и офлайн-копии с временем чтения. Для поддерживаемых проектов можно менять ещё не отправленные планы и проверять различия. Запуск требует отдельного разрешения и подтверждения ресурсов.
Реальные интерфейсы разрабатываемого приложения с демонстрационными настройками и имитацией задач. Реальные расчёты не запускались.
Сначала подключите свой компьютер или сервер, выполните сопряжение устройств и предоставьте права доступа.
Знакомые движки, сохранённая история работы
MolloM не является новым движком докинга или MD. Он вызывает существующие программы и сохраняет исходные результаты, параметры и попытки. Пакеты проектов содержат выбранные входы и результаты. Совместимые ИИ-агенты могут читать статус или готовить планы через MCP.
Где идут расчёты и как передаются данные
Докинг и симуляции выполняются на вашем компьютере или выбранном сервере. Подключение через аккаунт может передавать на телефон выбранные статусы задач, сводки и журналы. Установка программ и включённые внешние сервисы также используют сеть.
Передать операции, но не научное решение
Оценки докинга и траектории помогают сравнивать кандидатов, но сами по себе не доказывают связывание или механизм. Интерпретация также зависит от идентичности молекул, протонирования, силовых полей, выборки и экспериментальных данных.
Загрузки и платформы
Приложения для компьютеров и телефонов находятся в разработке. Официальных установщиков и ссылок на магазины пока нет. После выпуска здесь появятся загрузки, системные требования и инструкции.
Планируемые платформы
Компьютер
- macOSПубличный выпуск ещё не состоялся
- WindowsПубличный выпуск ещё не состоялся
- LinuxПубличный выпуск ещё не состоялся
Мобильные устройства
- iOS / iPadOSПубличный выпуск ещё не состоялся
- AndroidПубличный выпуск ещё не состоялся
- HarmonyOS NEXTПубличный выпуск ещё не состоялся